De TATA-doos, In de celbiologie is het een consensus-DNA-sequentie die wordt aangetroffen in alle lijnen van levende organismen en die op grote schaal wordt geconserveerd. De volgorde is 5'-TATAAA-3 'en kan worden gevolgd door enkele herhaalde adenines.
De locatie van de box is stroomopwaarts (of stroomopwaarts, zoals het in de literatuur vaak wordt genoemd) vanaf het begin van de transcriptie. Dit bevindt zich in het promotorgebied van genen, waar de vereniging met transcriptiefactoren zal plaatsvinden. Naast deze factoren heeft RNA-polymerase II de neiging zich te binden aan de TATA-box..
Hoewel de TATA-box de belangrijkste promotersequentie is, zijn er genen die deze missen.
Artikel index
Het begin van RNA-synthese vereist RNA-polymerase om te binden aan specifieke sequenties in DNA, promotors genaamd. De TATA-box is de consensussequentie van een promotor. Het wordt de Pribnow-doos in prokaryoten en de Goldberg-Hogness-doos in eukaryoten genoemd.
De TATA-box is dus een geconserveerd gebied in DNA. Sequentie-analyse van talrijke DNA-transcriptionele startregio's toonde aan dat de consensussequentie, of gemeenschappelijke sequentie, (5 T) T * A * TAAT * (3ʾ) is. Posities gemarkeerd met een asterisk hebben een hoge homologie. De laatste rest T wordt altijd gevonden in promotors van E coli.
Volgens afspraak krijgen basenparen die overeenkomen met het begin van de synthese van een RNA-molecuul positieve getallen en krijgen basenparen die voorafgaan aan de start van RNA een negatief getal. TATA-box bevindt zich in regio -10.
Aan E coli, het promotorgebied is tussen de posities -70 en +30. In dit gebied is er een tweede consensussequentie (5ʾ) T * TG * ACA (3ʾ) op positie -35. Evenzo hebben posities gemarkeerd met een asterisk een hoge homologie..
In eukaryoten hebben de promotorregio's signaalelementen die verschillen voor elk van de RNA-polymerasen. Aan E coli een enkel RNA-polymerase identificeert signaalelementen in het promotorgebied.
Bovendien zijn in eukaryoten de promotorregio's meer verspreid. Er zijn verschillende sequenties, gelokaliseerd in de -30 en -100 regio, die verschillende combinaties in de verschillende promoters tot stand brengen.
In eukaryoten zijn er talrijke transcriptiefactoren die een interactie aangaan met promotors. De TFIID-factor bindt bijvoorbeeld aan de TATA-sequentie. Aan de andere kant zijn ribosomale RNA-genen gestructureerd in de vorm van meerdere genen, de ene gevolgd door de andere..
Variaties in de consensussequenties van de -10- en -35-regio's veranderen de binding van RNA-polymerase aan het promotorgebied. Aldus veroorzaakt een mutatie van een enkel basenpaar een afname in de snelheid van binding van RNA-polymerase aan het promotorgebied..
De TATA-box neemt deel aan de binding en initiatie van transcriptie. Aan E coli, het RNA-polymerase-holoenzym bestaat uit vijf α-subeenhedentweeββσ. De σ-subeenheid bindt zich aan het dubbelstrengige DNA en beweegt op zoek naar de TATA-box, het signaal dat het begin van het gen aangeeft.
De σ-subeenheid van RNA-polymerase heeft een zeer hoge promotorassociatieconstante (in de volgorde 10elf), wat duidt op een hoge herkenningsspecificiteit tussen het en de Pribnow-boxreeks.
RNA-polymerase bindt zich aan de promotor en vormt een gesloten complex. Het vormt dan een open complex dat wordt gekenmerkt door de lokale opening van 10 basenparen van de dubbele DNA-helix. Deze opening wordt vergemakkelijkt omdat de volgorde van de Pribnow-box rijk is aan A-T.
Wanneer het DNA wordt afgewikkeld, vormt zich de eerste fosfodiësterbinding en begint de verlenging van het RNA. De σ-subeenheid wordt vrijgegeven en het RNA-polymerase verlaat de promotor. Andere RNA-polymerasemoleculen kunnen binden aan de promotor en beginnen met transcriptie. Op deze manier kan een gen meerdere keren worden getranscribeerd..
In gist bestaat RNA-polymerase II uit 12 subeenheden. Dit enzym initieert de transcriptie door twee soorten consensussequenties te herkennen aan het 5ʾ-uiteinde van het begin van transcriptie, namelijk: TATA-consensussequentie; CAAT-consensussequentie.
RNA-polymerase II vereist eiwitten, TFII-transcriptiefactoren genaamd, om een actief transcriptiecomplex te vormen. Deze factoren zijn redelijk geconserveerd in alle eukaryoten..
Transcriptiefactoren zijn eiwitmoleculen die kunnen binden aan het DNA-molecuul en de productie van een specifiek gen kunnen verhogen, verlagen of stoppen. Deze gebeurtenis is cruciaal voor genregulatie.
De vorming van het transcriptiecomplex begint met de binding van het TBP-eiwit ("TATA-bindend eiwit") aan de TATA-box. Dit eiwit bindt op zijn beurt TFIIB, dat ook aan DNA bindt. Het TBP-TFIIB-complex bindt aan een ander complex dat bestaat uit TFIIF en RNA-polymerase II. Op deze manier helpt TFIIF RNA-polymerase II te binden aan de promotor..
Uiteindelijk komen TFIIE en TFIIH samen en creëren ze een gesloten complex. TFIIH is een helicase en bevordert de dubbelstrengs scheiding van DNA, een proces dat ATP vereist. Dit gebeurt nabij de startplaats van de RNA-synthese. Op deze manier wordt het open complex gevormd.
Het p53-eiwit is een transcriptiefactor, ook wel bekend als het p53-tumorsuppressoreiwit. Het is het product van een dominant oncogen. Li-Fraumeni-syndroom wordt veroorzaakt door een kopie van dit gemuteerde gen, dat de ontwikkeling van carcinomen, leukemie en tumoren veroorzaakt.
Van P53 is bekend dat het de transcriptie van sommige genen remt en die van andere activeert. P53 voorkomt bijvoorbeeld transcriptie van genen met een TATA-promotor door een complex te vormen dat bestaat uit p53, andere transcriptiefactoren en de TATA-promotor. Zo houdt p53 de celgroei onder controle..
Niemand heeft nog op dit artikel gereageerd.