Transferase processen, functies, nomenclatuur en subklassen

4807
Simon Doyle

De transferases het zijn enzymen die verantwoordelijk zijn voor het overbrengen van functionele groepen van een substraat dat als donor fungeert naar een substraat dat als receptor fungeert. Bij de meeste metabolische processen die essentieel zijn voor het leven, zijn transferase-enzymen betrokken.

De eerste waarneming van de reacties die door deze enzymen worden gekatalyseerd, werd in 1953 gedocumenteerd door Dr. R. K. Morton, die de overdracht observeerde van een fosfaatgroep van een alkalische fosfatase naar een β-galactosidase die fungeerde als een receptor voor de fosfaatgroep..

Glycine N-methyltransferase (Bron: Jawahar Swaminathan en MSD-medewerkers van het European Bioinformatics Institute [Public domain] via Wikimedia Commons)

De nomenclatuur van de transferase-enzymen wordt over het algemeen uitgevoerd volgens de aard van het molecuul dat de functionele groep in de reactie accepteert, bijvoorbeeld: DNA-methyltransferase, glutathion-transferase, 1,4-α-glucaan 6-α-glucosyltransferase, onder andere.

Transferases zijn enzymen met biotechnologisch belang, vooral in de voedings- en geneesmiddelenindustrie. Hun genen kunnen worden aangepast om specifieke activiteiten in organismen uit te voeren, waardoor ze direct bijdragen aan de gezondheid van de consument, buiten het voedingsvoordeel..

Prebiotische geneesmiddelen voor de darmflora zijn rijk aan transferases, omdat deze deelnemen aan de vorming van koolhydraten die de groei en ontwikkeling van nuttige micro-organismen in de darm bevorderen..

Tekortkomingen, structurele schade en onderbrekingen in de processen die door transferases worden gekatalyseerd, veroorzaken de ophoping van producten in de cel, waardoor veel verschillende ziekten en pathologieën met dergelijke enzymen worden geassocieerd..

Het niet goed functioneren van transferases veroorzaakt ziekten zoals onder meer galactosemie, de ziekte van Alzheimer en de ziekte van Huntington.

Artikel index

  • 1 Biologische processen waaraan ze deelnemen
  • 2 functies
  • 3 Nomenclatuur
  • 4 subklassen
    • 4.1 EC.2.1 Transfer groepen van een koolstofatoom
    • 4.2 EC.2.2 Transfer aldehyde- of ketongroepen
    • 4.3 EC.2.3 Acyltransferasen
    • 4.4 EC.2.4 Glycosyltransferases
    • 4.5 EC.2.5 Transfer alkyl- of arylgroepen, behalve methylgroepen
    • 4.6 EC.2.6 Transfer stikstofgroepen
    • 4.7 EC.2.7 Transfer groepen die fosfaatgroepen bevatten
    • 4.8 EC.2.8 Overdrachtsgroepen die zwavel bevatten
    • 4.9 EC.2.9 Transfer groepen die selenium bevatten
    • 4.10 EC.2.10 Transfer groepen die molybdeen of wolfraam bevatten
  • 5 referenties

Biologische processen waaraan ze deelnemen

Onder het grote aantal metabolische processen waaraan transferases deelnemen, zijn de biosynthese van glycosiden en het metabolisme van suikers in het algemeen..

Een glucotransferase-enzym is verantwoordelijk voor de conjugatie van A- en B-antigenen op het oppervlak van rode bloedcellen. Deze variaties in antigeenbinding zijn afkomstig van een polymorfisme van de Pro234Ser-aminozuren met de oorspronkelijke structuur van B-transferases..

Glutathion-S-transferase in de lever neemt deel aan de ontgifting van levercellen en helpt ze te beschermen tegen reactieve zuurstofsoorten (ROS), vrije radicalen en waterstofperoxiden die zich ophopen in het celcytoplasma en zeer giftig zijn.

Glutathione-S-Transferase (Bron: Jawahar Swaminathan en MSD-personeel van het European Bioinformatics Institute [Public domain] via Wikimedia Commons)

Aspartaatcarbamoyltransferase katalyseert de biosynthese van pyrimidinen in het metabolisme van nucleotiden, fundamentele componenten van nucleïnezuren en hoogenergetische moleculen die worden gebruikt in meerdere cellulaire processen (zoals ATP en GTP, bijvoorbeeld).

Transferases nemen rechtstreeks deel aan de regulering van veel biologische processen door de DNA-sequenties die coderen voor de informatie die nodig is voor de synthese van cellulaire elementen door epigenetische mechanismen tot zwijgen te brengen..

Histonacetyltransferasen acetyleren geconserveerde lysineresten op histonen door een acetylgroep over te brengen van een acetyl-CoA-molecuul. Deze acetylering stimuleert de activering van transcriptie geassocieerd met de ontwikkeling of relaxatie van euchromatine..

Fosfotransferasen katalyseren de overdracht van fosfaatgroepen in waarschijnlijk alle cellulaire metabolische contexten. Heeft een belangrijke rol bij de fosforylering van koolhydraten.

Aminotransferasen katalyseren de omkeerbare overdracht van aminogroepen van aminozuren naar oxaciden, een van de vele aminozuurtransformaties die worden gemedieerd door vitamine B6-afhankelijke enzymen..

Kenmerken

Transferases katalyseren de beweging van chemische groepen door de onderstaande reactie uit te voeren. In de volgende vergelijking staat de letter "X" voor het donormolecuul van de functionele groep "Y" en fungeert "Z" als de acceptor.

X-Y + Z = X + Y-Z

Dit zijn enzymen met sterke elektronegatieve en nucleofiele elementen in hun samenstelling; deze elementen zijn verantwoordelijk voor de overdrachtscapaciteit van het enzym.

De door de transferases gemobiliseerde groepen zijn in het algemeen onder meer aldehyde- en ketonresten, acyl-, glucosyl-, alkyl-, stikstof- en stikstofrijke groepen, fosfor- en zwavelhoudende groepen..

Nomenclatuur

De classificatie van transferases volgt de algemene regels voor de classificatie van enzymen die zijn voorgesteld door de Enzyme Commission (Enzyme Commission) in 1961. Volgens de commissie krijgt elk enzym een ​​numerieke code voor zijn classificatie.

De positie van de cijfers in de code geeft elk van de divisies of categorieën in de classificatie aan en deze cijfers worden voorafgegaan door de letters "EC".

Bij de classificatie van transferases staat het eerste getal voor de enzymklasse, het tweede getal symboliseert het type groep dat ze overdragen en het derde getal verwijst naar het substraat waarop ze werken..

De nomenclatuur van de klasse van transferases is EC.2. Het heeft tien subklassen, dus enzymen worden gevonden met de code van EC.2.1 tot de EC.2.10.  Elke aanduiding van de subklasse wordt voornamelijk gemaakt volgens het type groep dat het enzym overdraagt.

Subklassen

De tien klassen van enzymen binnen de transferasefamilie zijn:

EC.2.1 Transfer groepen van een koolstofatoom

Ze dragen groepen over die een enkele koolstof bevatten. Methyltransferase brengt bijvoorbeeld een methylgroep (CH3) over naar de stikstofbasen van DNA. De enzymen van deze groep regelen rechtstreeks de vertaling van genen.

EC.2.2 Aldehyde- of ketongroepen overbrengen

Ze mobiliseren aldehydegroepen en ketongroepen met sacchariden als receptorgroepen. Carbamyltransferase vertegenwoordigt een mechanisme van regulatie en synthese van pyrimidines.

EC.2.3 Acyltransferasen

Deze enzymen dragen acylgroepen over in aminozuurderivaten. Peptidyltransferase zorgt voor de essentiële vorming van peptidebindingen tussen aangrenzende aminozuren tijdens het translatieproces.

EC.2.4 Glycosyltransferases

Ze katalyseren de vorming van glycosidebindingen door fosfaatsuikergroepen als donorgroepen te gebruiken. Alle levende wezens presenteren DNA-sequenties voor glycosyltransferasen, aangezien ze deelnemen aan de synthese van glycolipiden en glycoproteïnen.

EC.2.5 Transfer alkyl- of arylgroepen, behalve methylgroepen

Ze mobiliseren alkyl- of arylgroepen (anders dan CH3) zoals bijvoorbeeld dimethylgroepen. Een daarvan is glutathiontransferase, dat eerder werd genoemd..

EC.2.6 Transfer stikstofgroepen

Enzymen van deze klasse dragen stikstofgroepen over zoals -NH2 en -NH. Deze enzymen omvatten aminotransferasen en transaminasen..

EC.2.7 Transfer groepen die fosfaatgroepen bevatten

Ze katalyseren de fosforylering van substraten. Over het algemeen zijn de substraten van deze fosforyleringen suikers en andere enzymen. Fosfotransferasen transporteren suikers de cel in en fosforyleren ze tegelijkertijd.

EC.2.8 Overdrachtsgroepen die zwavel bevatten

Ze worden gekenmerkt door het katalyseren van de overdracht van groepen die zwavel in hun structuur bevatten. Co-enzym A-transferase behoort tot deze subklasse.

EC.2.9 Transfer groepen die selenium bevatten

Ze zijn algemeen bekend als seleniotransferases. Deze mobiliseren L-seril-groepen om RNA's over te dragen.

EC.2.10 Transfer groepen die moly of wolfraam bevatten

De transferases van deze groep mobiliseren groepen die molybdeen of wolfraam bevatten tot moleculen die sulfidegroepen als acceptoren hebben..

Referenties

  1. Alfaro, J. A., Zheng, R. B., Persson, M., Letts, J. A., Polakowski, R., Bai, Y.,… & Evans, S. V. (2008). ABO (H) bloedgroep A en B glycosyltransferasen herkennen substraat via specifieke conformatieveranderingen. Journal of Biological Chemistry, 283 (15), 10097-10108.
  2. Aranda Moratalla, J. (2015). Computationele studie van DNA-methyltransferasen. Analyse van het epigenetische mechanisme van DNA-methylatie (proefschrift-doctoraal, Universiteit van Valencia-Spanje).
  3. Armstrong, R. N. (1997). Structuur, katalytisch mechanisme en evolutie van de glutathiontransferases. Chemisch onderzoek in toxicologie, 10 (1), 2-18.
  4. Aznar Cano, E. (2014). Faagstudie van "Helicobacter pylori" door fenotypische en genotypische methoden (Proefschrift, Complutense Universiteit van Madrid)
  5. Boyce, S., & Tipton, K. F. (2001). Enzymclassificatie en nomenclatuur. eLS.
  6. Bresnick, E., & Mossé, H. (1966). Aspartaatcarbamoyltransferase uit rattenlever. Biochemical Journal, 101(1), 63.
  7. Gagnon, S. M., Legg, M. S., Polakowski, R., Letts, J. A., Persson, M., Lin, S.,… & Borisova, S. N. (2018). Geconserveerde residuen Arg188 en Asp302 zijn cruciaal voor actieve site-organisatie en katalyse in humane ABO (H) -bloedgroep A- en B-glycosyltransferasen. Glycobiology, 28 (8), 624-636
  8. Grimes, W. J. (1970). Siaalzuurtransferases en siaalzuurniveaus in normale en getransformeerde cellen. Biochemistry, 9 (26), 5083-5092.
  9. Grimes, W. J. (1970). Siaalzuurtransferases en siaalzuurniveaus in normale en getransformeerde cellen. Biochemie, 9(26), 5083-5092.
  10. Hayes, J. D., Flanagan, J. U., & Jowsey, I. R. (2005). Glutathion-transferases. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol., Vier vijf, 51-88.
  11. Hersh, L. B., & Jencks, W. P. (1967). Co-enzym A Transferase kinetiek en uitwisselingsreacties. Journal of Biological Chemistry, 242 (15), 3468-3480
  12. Jencks, W. P. (1973). 11 Co-enzym A-transferases. In The enzymen (Vol. 9, pp. 483-496). Academische pers.
  13. Lairson, L. L., Henrissat, B., Davies, G. J., & Withers, S. G. (2008). Glycosyltransferases: structuren, functies en mechanismen. Jaaroverzicht van biochemie, 77
  14. Lairson, L. L., Henrissat, B., Davies, G. J., & Withers, S. G. (2008). Glycosyltransferases: structuren, functies en mechanismen. Jaaroverzicht van biochemie, 77.
  15. Lambalot, R. H., Gehring, A. M., Flugel, R. S., Zuber, P., LaCelle, M., Marahiel, M. A., ... & Walsh, C. T. (1996). Een nieuwe enzymsuperfamilie de fosfopantetheinyltransferases. Chemie en biologie, 3(11), 923-936
  16. Wilde eend, C., Tolcos, M., Leditschke, J., Campbell, P., & Rees, S. (1999). Vermindering van de immunoreactiviteit van choline-acetyltransferase, maar niet van de immunoreactiviteit van de muscarine-m2-receptor in de hersenstam van SIDS-zuigelingen. Journal of neuropathology and experimentele neurologie, 58 (3), 255-264
  17. Mannervik, B. (1985). De iso-enzymen van glutathiontransferase. Vooruitgang in enzymologie en aanverwante gebieden van moleculaire biologie, 57, 357-417
  18. MEHTA, P. K., HALE, T. I., & CHRISTEN, P. (1993). Aminotransferases: demonstratie van homologie en onderverdeling in evolutionaire subgroepen. European Journal of Biochemistry, 214(2), 549-561
  19. Monro, R. E., Staehelin, T., Celma, M. L., & Vazquez, D. (1969, januari). De peptidyltransferase-activiteit van ribosomen. In Cold Spring Harbor-symposia over kwantitatieve biologie (Deel 34, blz. 357-368). Cold Spring Harbor Laboratory Press.
  20. Montes, C. P. (2014). Enzymen in voedsel? Biochemie van het eetbare. UNAM University Magazine, vijftien, 12.
  21. Morton, R. K. (1953). Transferase-activiteit van hydrolytische enzymen. Natuur, 172(4367), 65.
  22. Negishi, M., Pedersen, L. G., Petrotchenko, E., Shevtsov, S., Gorokhov, A., Kakuta, Y., & Pedersen, L. C. (2001). Structuur en functie van sulfotransferasen. Archieven van biochemie en biofysica, 390(2), 149-157
  23. Nomenclatuurcomité van de Internationale Unie voor Biochemie en Moleculaire Biologie (NC-IUBMB). (2019). Opgehaald van qmul.ac.uk
  24. Rej, R. (1989). Aminotransferasen bij ziekte. Klinieken in laboratoriumgeneeskunde, 9(4), 667-687.
  25. Xu, D., Song, D., Pedersen, L. C., & Liu, J. (2007). Mutationeel onderzoek van heparansulfaat 2-O-sulfotransferase en chondroïtinesulfaat 2-O-sulfotransferase. Journal of Biological Chemistry, 282(11), 8356-8367

Niemand heeft nog op dit artikel gereageerd.